يقوم المركز بأعمال وأنشطة عديدة لتحقيق أهدافه، وهي:
- إجراء البحوث والدراسات -النظرية والتطبيقية- التي ترتبط بالمجتمع الصومالي ومجتمعات شرق إفريقيا، سعيا إلى رصد الظواهر الاجتماعية والاقتصادية وغيرها في المجالات المختلفة وتحليلها، بما يساعد على مواجهتها والتعامل معها.
- إجراء البحوث والدراسات الأكاديمية بهدف تأصيل وتعميق مجالات التخصص.
- إجراء البحوث والدراسات بالاشتراك مع الجهات والمؤسسات العلمية المحلية والدولية في إطار التعاون بين المركز وتلك الجهات والمؤسسات.
- تنظيم الورش العلمية للباحثين، بما يعين على رفع الكفاءة العلمية والفنية والمهنية لباحثي المركز، ويكّوِنُ بيئة علمية ممتازة بالنسبة للمجتمع الثقافي.
- عقد الندوات والمؤتمرات العلمية والدورات التدريبية لتأكيد التواصل العلمي بين الباحثين والمتخصصين في مختلف المجالات المعرفية وبين المجتمع.
- عقد الدورات التدريبية لطلبة الجامعات وغيرهم من طلبة المعاهد والمدارس الثانوية فيما يخص الشؤون العلمية.
- إصدار مجلة علمية دورية لنشر البحوث العلمية المحكمة في مختلف المجالات.
- إصدار مجلة ثقافية فصلية لنشر الدراسات والمقالات في مختلف المجالات.